La Fundación Hondureña de Investigación Agrícola lidera la investigación y el desarrollo en cuatro programas fundamentales que abarcan diversos aspectos de la agricultura en Honduras:

• Banano y Plátano 
• Cacao y Agroforestería
• Diversificación
• Hortalizas

Estos programas representan áreas clave de investigación y desarrollo que buscan mejorar la productividad, la sostenibilidad y la rentabilidad en el sector agrícola hondureño. Desde el mejoramiento genético de las variedades de cultivos hasta la implementación de prácticas agrícolas sostenibles y la promoción de la diversificación de cultivos, la FHIA desempeña un papel crucial en el impulso de la agricultura en Honduras hacia un futuro más próspero y equitativo.